В начале 90-х стал лауреатом фестиваля «Оскольская Лира», и с тех пор был неизменным членом жюри (лауреатом фестиваля был Веня Д’ркин и множество других интересных авторов).

На протяжении 90-х и начала 2000-х годов считался одной из знаковых фигур в отечественной контркультуре. Взгляды Непомнящего эволюционировали от радикально левых к национально-патриотическим, а затем Непомнящий пришел к Православию. Его перу принадлежат несколько песен, ставших манифестами современной православной молодёжи, а статья «Православие и рок-музыка» (которую сам автор, впрочем, не считал удачной) стала важным аргументом в дискуссии о возможности диалога между рок-музыкантами и Церковью. После воцерковления поэта часть текстов (например, "Ветхозаветная" из альбома "Темная сторона любви", где для описания отношения Бога к человеку использовалась обсценная лексика) были удалены из доступных к прослушиванию с сайта поэта.

С 2004 года Непомнящий страдал от глиобластомы — злокачественной опухоли головного мозга. В Москве и других городах проходили благотворительные акции, на которых собирались деньги на лечение. Музыкант перенёс операцию в начале июня 2004 года; затем произошёл рецидив, и ещё одну операцию ему сделали 16 октября 2006 года.

20 апреля 2007ого года его не стало…

Помню, как на официальном сайте вели дневник его болезни и постоянно обновляли информацию о его здоровье. Тогда все действительно рассчитывали на его выздоровление. Но вышло совсем не так…

Ушел Веня Д’ркин, ушел Александр Непомнящий, не так давно не стало Егора Летова, после того, как он записал один из лучших своих альбомов…

У меня на полке лежит мр3 диск Александра, средства от продажи которого, пошли на его лечение. Очень жаль, что ничего не помогло.

Но осталось большое наследие Алекса́ндра Евге́ньевича, большое количество поклонников, а сам Непомнящий успел найти свой путь…